住在不知天空为何物的村庄基哈的少年“西蒙”在开垦村庄时，偶然挖掘到一块闪耀着神秘光芒的晶体。在那之后，巨大的机器人从天井中冲入，对村庄进行大肆破坏，西蒙与大哥卡米纳以及从地面来的少女优子一起，与巨大的机器人展开了殊死的战斗……

这是最强的两人一去不复返的青春。2018年6月，虎杖悠仁让两面宿傩寄宿于自身体内。2017年12月，乙骨忧太解开祈本里香的诅咒。然后时光一路回溯至2006年的春天——高专时代的五条悟与夏油杰的故事展开了。身为表现活跃的咒术师并所向无敌的两人，接到来自拥有不死术式的咒术界关键──天元的委托。委托任务为，针对天元的适配者“星浆体”天内理子，二人需要担任那名少女的护卫，并且将其抹消。为了使咒术界永存，两人前往执行护卫任务，却在这时有一名自称伏黑的“术师杀手”介入，企图暗杀“星浆体”，成为最强咒术师与最凶恶咒诅师

云青岩凭借仙帝手段，镇压了一个又一个敌人，化解了一次又一次的危机。当他有一天，回首过去的时候，他已经站在了天元王朝的巅峰。此时的云青岩，眼中看到的，早已不是小小的天元王朝，而是那浩瀚无垠的星辰大海，于

少年战斗着——“为寻求正确的生存方式”。 辛酸、后悔、耻辱，人类产生的负面情感，化为诅咒，潜入日常生活。 诅咒是蔓延于世界的祸源，最糟糕的情况下，会让人类踏入死亡，并且诅咒只能以诅咒祓除。 虎杖悠仁是一位体育万能的高中生，某天捡到了一个被布条所包裹的手指，并将其交予其研究灵异事件的社团中的学姐，由此认识了咒术师五条悟，并进入对诅咒专门机关“东京都立咒术高等专门学校”，遇到了伏黑惠与钉崎野蔷薇这两位同学。 而往前追溯到2006年春——五条悟和夏油杰还在高专时期。成为咒术师大显身手，所向无敌的两人，接到了拥有

天元的宇宙决战后，濒死的罗煞在千钧一发之际，被远古超文明时代爆裂帝王——猎天魄所救，来到地球。罗煞为了复仇，企图集齐6枚隐藏在遗迹里的爆裂晶片，复活猎天魄，利用其征服世界。飞伦和擎锋从天元宇宙胜利归来，后得知罗煞其意图。飞伦、擎锋与周皓博士联手，开始了阻止猎天魄复活的行动。